International Human Microbiome Consortium

Posted on 27. Oct, 2008 by Luis A. Alcaraz in Actualidad.

En una conferencia organizada por el EMBL, científicos de todo el mundo han anunciado la formación del International Human Microbiome Consortium (INHC), en un esfuerzo que los científicos esperan que conduzca a la compresión de la relación existentie entre el microbioma humano y la salud.

Uno de los efectos colaterales del Proyecto Genoma Humano fue que puso de moda la investigacióin con los sufijos oma y ómica. Los científicos fueron otorgándole mayor importancia al estudio del conjunto frente lo individual, la relevancia del total (por ejemplo de proteínas) y sus interacciones frente al estudio de una simple molécula. Así surgieron proyectos que todavia siguen vigentes para estudiar el proteoma humano, el transcriptoma y uno de los que parece más prometedores por sus posibilidades diagnósticas (entre otras): el metaboloma. Ahora entra en escena un nuevo actor, quizá más grande y más complejo que los anteriores: el microbioma humano.

Nuestro cuerpo está repleto de microorganismos. Tantos, que se calcula que en un undividuo sano se estima que multiplican por diez el número de céulas humnas. De este hecho se deduce que, además, estos microorganismos son beneficiosos para nosotros. No sólo eso, sino que existen diversas enfermedades que se sospecha que están relacionadas con la ruptura del equilibrio de la flora microbiana. Sin embargo, poco se conoce de estos microorganismos. Por este motivo, el NIH inició el Human Microbiome Project, con la intencion de caracterizar y estudiar esos microorganismos y analizar su papel en la salud y enfermedad humana.

Este proyecto pretende secuenciar unos 600 genomas de microbios presentes en el cuerpo humano, que combinados con los ya existentes y otros planeados por otras iniciativas, harán un total de 1.000 genomas de microorganismos. Para realizar esta secuenciación, no sólo se partirá de organismos aislados. Algunos de estos microorganismos no han podido cultivarse aisladamente, por lo que se seguirá una aproximación muy interesante: la metagenómica. La metagenómica pretende estudiar los microorganisos en su ambiente natural, si necesidad de cultivarlos aisladamente. Esto es posible gracias a las nuevas técnicas de secuenciación.

Las iniciativas de este proyecto son varias:

• Desarrollo de una serie de secuencias de genomas de referencia y una caracterización preliminar del microbioma humano. Además de secuenciar los 600 genomas, se pretende realizar un análisis para saber si existe un determinado core de microorganismos en diversos sitios del cuerpo. Esto último se realizará mediante la secuenciación del 16S ARNr.
• Relación entre enfermedades y cambios en el microbioma.
• Desarrollo de nuevas tecnologías. Para poder realizar este proyecto, se deben desarrollar tecnologías que permitan abaratar los costes de la secuenciación, además de poder ser utilizadas en proyectos de metagenómica.
• Desarrollo de nuevas herramientas computacionales. A media que la cantidad de datos aumenta, se hace necesario de nuevas herramientas analíticas para poder extraer datos relevantes.
• Establecimiento de un centro de datos y coordinación.
• Establecimiento de un centro de muestras. Todas las muestras obtenidas se pondrán a disposición de toda la comunidad científica a un coste razonable.
• Implicaciones éticas, sociales y legales del proyecto.

El INHC viene a sumar esfuerzos de múltiples paises para completar el microbioma humano, en el que se encuentra no sólo el NIH, si no que también participan paises como Canadá, China y Australia, aunque está abierto a cualquier investigador que acepte sus principios.

En definitiva, un gran proyecto del que seguro que hablaremos mucho en los próximos años. Los datos obtenidos se harán públicos a través del EMBL y del NIH.

Podeis encontrar más información en la página del NIH y del propio poyecto.

Vía OBBeC.

Imagen de cabecera por Idonexus.

Tags: embl, investigación, microbioma, nih