Alianza entre Illumina y Oxford Nanopore

Posted on 13. Jan, 2009 by Luis A. Alcaraz in Actualidad.

Las empresas biotecnológicas están empezando a tomar posiciones respecto a las técnicas de secuenciación de tercera generación. Ahora mismo estamos en un momento crítico, en el que todavía no está nada decidido sobre cuál será la mejor tecnología cara al futuro. Es el momento de hacer acuerdos estratégicos para posicionarse en el mercado de la secuenciación rápida y barata, y seguro que a lo largo del 2.009 asistiremos a más alianzas de este tipo.

Las empresas que pueden, desarrollan sus propios sistemas de ultrasecuenciación, y las que no se buscan socios clave. Este es el orgien de la alianza entre Illumina y Oxford Nanopore. Con esta alianza Illumina se hace con los derechos de distrubición del invento de Nanopore entrando así de lleno en el mercado de la secuenciación de tercera generación, y este consigue financiación para el desarrollo de un producto que todavía no está terminado. Además Nanopore ve el camino abierto para la comercialización de sus productos, al contar con la maquinaria de marketing, distribución y experiencia de Illumina.

La tecnología de Nanopore es muy ingeniosa. Usa un nanoporo proteico acoplado a una exonucleasa para secuenciar el ADN. La encima va ropiendo bases individuales de una cadena de ADN, e introduce estas bases en el nanoporo. Una corriente iónica fluye contínuamente a través del nanoporo, y a medida que las bases atraviesan el nanoporo, cada una interrumpe la corriente de una forma característica. Esta señal se recoge electrónicamente y se interpreta para identificar la base de ADN. Recogiendo de múltiples canales en paraleo podemos realizar una secuenciación de alto rendimiento. En el siguiente video podeis ver una representación de cómo funciona la tecnología.

Las ventajas de la técnica son evidentes. En primer lugar, no depende de un marcaje fluorescente y por tanto no hay ninguna óptica para su detección (ni obviamente lásers) lo que presumiblemente disminuirá los costes de la secuenciación. Además, es sensible a nivel de una única molécula, lo que podría implicar que no se necesitaría nigún paso previo de amplificación del ADN.

Illumina aportará 18 millones de dólares para el desarrollo de esta tecnología, conocida como BASETM, además de otra inversión cuando se consiga un hito específico (¿cuál será?, se admiten apuestas).

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